ローゼンメイデンゲベートガルテン
□パート別
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「アドベンチャーパート」
立ち絵のキャラクターや描き下ろしCGが表示され、ストーリーを進行させていくパート。ゲームのほとんどはこのアドベンチャーパートで構成されている。このアドベンチャーパートで時折表示される2択の選択肢を選ぶことで、真紅たちローゼンメイデンの信頼度が変化する。
この信頼度はストーリーの展開だけではなく「アリスゲームパート」でのローゼンメイデンたちの能力にも影響する。信頼度が高ければアリスゲームでのキャラクターの攻撃力の強さが変化し、戦いを有利に進めることができる。
また、この「アドベンチャーパート」は前作をプレイしたユーザーの要望を取り入れつつ大幅に強化されている。「ローゼンメイデンとの契約を断わる」「真紅以外のローゼンメイデンと一緒にストーリー進める」などプレイの自由度のアップをはじめ、ストーリーボリュームの増加、表示されるキャラクターの「目パ チ」「口パク」「動き」などもより豊かも表現されるようになった。さらにこのゲームでしか見ることのできないシナリオやイベントも収録されている。
「アリスゲームパート」
アリスゲームパートは「アドベンチャーパート」に挿入される格闘ゲーム要素で、プレイヤーは複数のドールの中から1体を選び(ストーリーによっては選べない場合もあり)、敵のドールと戦う。選択したキャラクターとの信頼度が高ければキャラクターの周りにオーラが現れ、攻撃時の光や威力が変化したり、特殊技や必殺技を発動するために必要な「ミーディアムコネクションゲージ」の上昇速度が速くなったりと戦いを有利に進めることができる。
また、アクション性の強いゲームに不慣れなプレイヤーのために、3回連続でアリスゲームに敗北すると戦闘終了後に表示されるメニュー画面に「ストーリーを先に進める」という項目が出現。これを選択することでその先の物語を楽しめるようになっている。